ФНС не отслеживает каждое поступление на карту самозанятого. Поэтому не обязательно заводить отдельную карту. Поступления от клиентов за выполненные услуги вы самостоятельно обозначаете, выдавая чек. И только с них у вас будет взиматься налог. Остальные доходы: переводы от родственников, возврат долга или другие личные поступления налогом не облагаются.
Подытожим: на данный момент учёт доходов производится исключительно самостоятельно плательщиком НПД. То есть то, что вы указали как доход от деятельности самозанятого (с помощью чека), это вам и пойдёт в расчёт налога.
Исключение: если у вас подключен сервис от банка-партнёра. Так, сервис «Свое дело» от Сбера автоматически формирует чеки при переводах физлиц (об этом подробнее в следующем посте). В таком случае действительно стоит завести отдельную карту для взаиморасчётов с клиентами, чтобы не платить лишний налог.
